A fundação do convento de San Francisco de Santiago remonta à peregrinação de São Francisco de Assis, em 1214, ao sepulcro do Apóstolo Santiago. Por petição de São Francisco, Cotolay (um pobre carbonífero) fundou o convento, cumprindo o desejo do Santo. O mausoléu de Cotolay está na estrada principal e, em frente, uma grande lápide de pedra explica a origem da fundação. O convento foi erguido fora da muralha da cidade no chamado "Vale do Inferno", que com a chegada dos frades passou a ser denominado como "Vale de Deus". O edifício atual é do século XVIII, mas conserva os arcos góticos originais de finais do século XIII. As janelas arqueológicas da entrada do convento mostram os restos da primeira igreja do século XIII. O convento de San Francisco de Santiago é a sede da Província Franciscana de Santiago, que inclui a Galiza, as Astúrias, Leão, Zamora, Salamanca, Palência e Valladolid, a "custódia" da Venezuela e a "delegação" de Tanger. Os frades franciscanos continuam a viver no convento, a sua casa, desenvolvendo diversas atividades dentro e fora do mesmo, como a evangélica, pastoral, social, docente e cultura, entre outras.
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1209: Fundação da Ordem Franciscana 1214: Peregrinação de São Francisco a Santiago de Compostela 1520: Celebração das Cortes de Castela, na sala capitular do Convento de San Francisco (atualmente, o auditório Carlos V), presidida pelo imperador Carlos V 1613: Construção do Claustro de la Fuete (chamado, processional) após a destruição do original em estilo gótico. 1679: Construção da escada principal do convento. 1719: Construção da sala "De Profundis" (restaurante). Os frades reunião aqui antes de entrar no refeitório a cantar o salmo De Profundis. 1730: Construção do Restaurante Monumental (antigo refeitório do convento) 1787: Finalização da construção da atual igreja de São Francisco. 1798: Mausoléu a Ctolay, fundador do primeiro convento, na entrada do convento. 1836: Exclaustração de Mendizábal. O convento de São Francisco foi exclaustrado e expropriado. 1854: Os irmãos García Pan, dois grandes benfeitores da comunidade franciscana, compraram o convento e a respetiva igreja para, anos mais tarde, os entregarem de novo aos frades. 1862: O colégio de Missionários para a Terra Santa e Marrocos foi transferido para o convento de San Francisco de Santiago de Compostela. Há uma inscrição na fachada do convento. 1912: Construção do átrio original do Pático de Cristal, com um armazém de ferro forjado. Parte destes trabalhos foram realizados nas oficinas de Gustave Eiffel. 1928: Monumento a São Francisco. Obra de Francisco Asorey, situada no Campillo de San Francisco (comemoração do VII centenário da morte de São Francisco) 1970: Abertura da residência universitária Hogar San Francisco. 1984: Hostal "Hogar San Francisco". Combina a sua atividade com a residência universitária. 1992: Fecho da residência universitária. O Hostal Hogar San Francisco mantém a sua atividade. 1993: Museu Tierra Santa. Abre as suas portas ao público. 2000: Reabilitação integral das suas instalações até 2005, adaptando-as aos padrões de qualidade de um hotel de 4 estrelas. 2005: Inauguração do San Francisco Hotel Monumento, em outubro.
Está localizado na zona alta do Claustro de la Fuente e é acedido a partir da igreja de São Francisco. Abriu as portas ao público em 1993. Propõe uma viagem desde o paleolítico até ao século XX, mostrando os lugares onde viveu Jesus de Nazaré. Vestígios arqueológicos das escavações franciscanas, talhas em madeira de oliveira e madrepérola com temas bíblicos, o monetário, ourivesaria e ornamentos das três religiões monoteístas presentes em Jerusalém (cristã, islâmica e judaica), são parte desta exposição única no mundo. A peça mais emblemática no Museu Tierra Santa é a maqueta da Basílica do Santo Sepulcro. Feita por Frei Bartolomé de las Heras, em 1950. Trata-se de uma maravilhosa réplica em madeira de oliveira do sagrado edifício, que também mostra o detalhe do interior do mesmo.
Em 1971 foi inaugurado o Centro Cultural e Social Albergue de Juan XXIII, por iniciativa de Frei José António Peteiro Freire. Desde então, o albergue acolhe as pessoas sem-abrigo da cidade. Além de lhes oferecer cama para dormir, também responde a outras necessidades ao longo do dia com a ajuda de voluntários. A comunidade franciscana nunca deixou de prestar este grande trabalho social e o seu compromisso para com os mais desfavorecidos continua muito presente nos dias de hoje.